Die Genossenschaft Fleischhhuis bezweckt in gemeinsamer Selbsthilfe den Betrieb eines Schlachthauses als Schlacht- und Verarbeitungsbetrieb für die Selbstversorgung der bäuerlichen Haushalte und die Direktvermarktung der Landwirtschaft. Nebenbei führt sie auch Schlachtungen für lokale Metzgereien durch. Ebenfalls werden Notschlachtungen durch den "Zweckverband für die Durchführung von Notschlachtungen" (ZVT) vollzogen.

Die Genossenschaft Fleischhuis ist Bio-zertifiziert und kann für entsprechende Kunden ihre Dienstleistungen nach den Richtlinien von Bio Suisse anbieten.

Die Fleischhhuis Obwalden AG führt den operativen Schlachtbetrieb im Schlachthaus Ei Sarnen für die Genossenschaft Fleischhuis seit dem 1. August 2021.